（一）秘书处
    协调办机关日常工作；负责文秘、机要、保密、档案、督查、信访工作；负责组织人事、劳动工资、后勤保障、纪检监察、思想教育，内部行政管理和机关党务、财务及离退休人员管理服务工作；负责相关会议的组织、协调工作；承办口岸国家安全、社会治安综合治理、普法教育和共建文明有关工作；负责行政复议和协调市人大、市政协议（提）案的答复工作。

    （二）综合业务处
    负责有关口岸建设长远发展规划的调研工作；负责口岸大通关建设的组织实施工作；负责口岸信息化建设工作；；负责口岸通关业务的投诉受（处）理工作；负责办综合业务信息的统计、分析工作；会同有关部门对口岸重大涉外经济纠纷案件的调查，并提出处理意见。

    （三）海港管理处
    负责海港口岸开放、扩大开放、临时开放和查验单位编制、基础设施建设项目的审查、报批工作；防口岸外贸运输的指导和协调工作；负责海港口岸涉外企业的日常管理协调工作，对海港口岸应急事件进行协调处置；负责宁波海港口岸通关中心及口岸港区现场的组织协调、管理服务工作；协调处理海港口岸工作中的争议；负责海港口岸信息的统计、分析、调研和共建文明口岸工作。

    （四）陆空港管理处
    负责航空、陆路口岸开放、扩大开放、临时开放的新开国际与地区客货运航线、查验单位编制、基础设施建设项目的审查、报批工作；负责口岸外事礼遇、重要贵宾、重大活动接待的协调工作；负责对空港口岸应急突发事件进行协调处置；负责空港口岸通关中心及陆路口岸通关现场的组织协调和服务工作；协调出溜空港口岸工作中的争议；负责陆空口岸信息的统计、分析、调研和共建文明口岸工作。

    （五）打击走私处
    依据党和国家反走私法律、法规、方针和政策和全国、省反走私工作部署与要求，研究提出我市贯彻实施意见；研究、分析我市活动的特点、规律，提出工作对策、措施，并组织落实；协调各缉私职能部门工作，指导走私大案、要案几疑难案件的查处；组织协调有关部门开展专项斗争和联合行动；受理反走私工作来信来访和举报；会通有关部门提出缉私调剂资金分配方案，监督检查专项经费管理使用情况；开展相关业务培训、宣传教育；负责打私信息的收集、统计、分析工作。

    （六）海防管理处
    负责协调有关部门开展海上综合治理和专项治理行动，打击海上各类违法犯罪活动；负责规范海上生产作业秩序的协调工作；负责涉外、涉台船舶及人员管理的指导工作；配合有关部门做好眼好地区军事设施保护工作；负责沿海重点地区海防安全监控系统基础设施建设管理的协调工作；配合有关部门开展隐蔽战线斗争，组织军警民联防；配合有关部门做好全市反偷渡人员的遣返工作；加强与驻甬部队的协调与联系，组织海防管理工作调研，提出工作措施与建议。